我觉得，工艺定型后批产的合格率应该考核生产部门吧

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考核质量还是不考核质量，关键看生产部门的职责是什么。我们单位生产运行部门只管资源的调配，不会直接管理产品的质量（当然资源调配不当会间接影响到产品或服务的质量），质量的控制依靠生产队站和技术、质量管理部门开展。